Более 3 тысяч военнослужащих Сухопутных войск Испании, расквартированных на территории Сеуты под командованием Генерального командования, получили приказ подготовиться к возможному нарушению территориального суверенитета ещё 27 июля. Как подтвердили источники в военных кругах изданию EL MUNDO, 28 июля все подразделения провели день в готовности: проверяли технику и снаряжали оружие. Распоряжение поступило после того, как Национальный разведывательный центр (CNI) и Центр разведки Вооружённых сил (CIFAS) зафиксировали призывы в социальных сетях к массовому переходу границы вплавь.

Таким образом, военные находились в состоянии повышенной готовности как минимум двое суток до начала событий. В казармах пересмотрели имеющиеся средства и подготовили материальную часть для возможного вмешательства. Цель состояла в том, чтобы в случае поступления приказа подразделения могли покинуть расположение практически мгновенно.

Когда в ночь с 29 на 30 июля начался массовый переход, находившиеся в казармах военные завершали подготовку, ожидая скорого приказа на выход. Однако, по данным нескольких источников, среди солдат и офицеров стало нарастать разочарование: они наблюдали, как тысячи людей проникают через район Тарахаль, а приказ так и не поступает. В это время на границе менее десяти сотрудников Гражданской гвардии пытались организовать непрерывный поток входящих мигрантов. В Мадриде начальник Генерального штаба обороны около полудня предложил министру обороны Маргарите Роблес отдать приказ о развёртывании, но этот шаг был остановлен после звонка из Монклоа (резиденции председателя правительства), сообщают источники.

Ситуация вызвала недоумение среди военных, остававшихся в полной готовности в своих частях. На месте давление на сотрудников Гражданской гвардии нарастало по мере умножения числа пересекающих границу, в то время как в казармах Генерального командования Сеуты военнослужащие продолжали ждать указаний. Разрыв между масштабом имеющегося военного контингента и числом тех, кому в итоге разрешили выйти, был особенно разительным для тех, кто пережил те часы внутри Вооружённых сил.

В 19:30, более чем через десять часов после начала массового перехода, когда основная масса тысяч мигрантов уже пересекла границу, Министерство обороны отдало приказ на выход для защиты территориальной целостности Испании. Однако развёртывание было ограниченным: из казарм вышли лишь около 300 военнослужащих Генерального командования Сеуты. «Вооружённые силы усилят Гражданскую гвардию в осуществлении её полномочий и тех, которые могут потребоваться для поддержания безопасности в городе Сеута. Мобилизованные силы будут координироваться оперативным командованием и окажут поддержку Гражданской гвардии», — говорилось в распространённой тогда заметке Минобороны. К этому часу на границе оставалось мало желающих пересечь её, а улицы Сеуты заполнились бронетехникой для поддержания общественного порядка.

Приказ поступил, когда наиболее критическая ситуация на пограничном переходе уже осталась позади. Развёртывание позволило усилить присутствие государства в различных точках города, однако для военных, часами ожидавших приказа, выход поставил точку в затянувшемся ожидании.

Солдаты, дислоцированные в Сеуте, регулярно отрабатывают подобные сценарии: ежегодно проводятся постоянные операции присутствия, наблюдения и сдерживания (OPVD), координируемые через Оперативное командование (MOPS). Последние учения такого рода прошли в марте. Военнослужащие знали, что делать, и были готовы двое суток, но их выход состоялся на десять часов позже начала кризиса и оказался недостаточным. Лишь на следующий день, 31 июля, когда 90% мигрантов уже вернулись в Марокко, к патрулированию привлекли около 2,5 тысяч солдат.